Caractérisation du micro-environnement inflammatoire de la muqueuse intestinale chez les patients atteints de sclérodermie // Characterization of the inflammatory microenvironment in the intestinal mucosa of patients with scleroderma.

La sclérodermie systémique (SSc) est une maladie auto-immune complexe qui combine vasculopathie, auto-immunité et fibrose, cette dernière étant responsable des complications graves et du sur-risque de mortalité chez les patients. Les atteintes digestives, fréquentes dans la SSc, peuvent affecter l'ensemble du tube digestif, entraînant des dysfonctionnements graves tels que la malabsorption ou les pseudo-obstructions chroniques. Pourtant, aucun traitement spécifique n'existe pour ces manifestations. Comprendre les mécanismes physiopathologiques de la fibrose digestive représente donc un enjeu majeur.
Les progrès des technologies multi-omiques permettent aujourd'hui d'étudier plus précisément les acteurs cellulaires et moléculaires de la fibrose. L'inflammation chronique, en tant que moteur initial, joue un rôle clé dans le développement de la fibrose. Cependant, la physiopathologie des atteintes digestives dans la SSc reste peu explorée, contrairement aux lésions cutanées ou pulmonaires. De plus, la diversité cellulaire de la muqueuse intestinale, liée à l'interaction avec le microbiome, pourrait fournir des pistes spécifiques. En nous appuyant sur les données des maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI), mieux décrites, nous proposons d'identifier les acteurs cellulaires et moléculaires de la réponse inflammatoire et fibrotiques dans les atteintes digestives de la SSc.
Notre projet vise à caractériser le micro-environnement inflammatoire et fibrotique des lésions digestives sclérodermiques. Nous utiliserons l'imagerie multiparamétrique à fluorescence (MACSima) sur des biopsies intestinales pour phénotyper les cellules immunitaires et stromales, mesurer leurs marqueurs d'activation, et analyser leurs interactions cellulaires. En complément, nous collecterons du tissu frais pour caractériser les sécrétomes pro-inflammatoires et pro-fibrotiques des lésions intestinales, en utilisant des approches moléculaires et protéomiques. Ces sécrétomes seront ensuite testés sur des fibroblastes et des cellules endothéliales en culture pour modéliser les mécanismes pro-fibrosants et vasculaires in vitro.
Les résultats attendus incluent l'identification des cellules immunitaires et molécules associées à la SSc digestive, ainsi que leurs fonctions pro-inflammatoires et pro-fibrosantes. Ce projet pourrait révéler de nouvelles cibles thérapeutiques pour traiter les formes intestinales de la SSc.
Prérequis : Connaissance théorique et pratique en immunofluorescence/immunohistochimie et immunologie. Des compétences en communication, organisation et collaboration sont également nécessaires pour les interactions avec les plateformes technologiques et l'équipe de recherche.
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Systemic sclerosis (SSc) is a complex autoimmune disease characterized by vasculopathy, autoimmunity, and fibrosis, the latter being responsible for severe complications and increased mortality risk in patients. Digestive involvement, frequent in SSc, can affect the entire gastrointestinal tract, leading to severe dysfunctions such as malabsorption or chronic pseudo-obstructions. However, no specific treatment currently exists for these manifestations. Understanding the pathophysiological mechanisms of digestive fibrosis is therefore a major challenge.

Advances in multi-omic technologies now allow for a more precise study of the cellular and molecular players involved in fibrosis. Chronic inflammation, as the initial driver, plays a key role in fibrosis development. However, the pathophysiology of digestive involvement in SSc remains poorly explored compared to cutaneous or pulmonary lesions. Moreover, the cellular diversity of the intestinal mucosa, influenced by interactions with the microbiome, could provide specific insights. Using data from better-characterized inflammatory bowel diseases (IBD), we aim to identify the cellular and molecular actors of the inflammatory and fibrotic responses in SSc-related digestive involvement.

Our project aims to characterize the inflammatory and fibrotic microenvironment of scleroderma digestive lesions. We will use multiparametric fluorescence imaging (MACSima) on intestinal biopsies to phenotype immune and stromal cells, measure their activation markers, and analyze their cellular interactions. Additionally, fresh tissue will be collected to characterize the pro-inflammatory and pro-fibrotic secretomes of intestinal lesions using molecular and proteomic approaches. These secretomes will then be tested on fibroblasts and endothelial cells in culture to model pro-fibrotic and vascular mechanisms in vitro.

The expected results include identifying immune cells and molecules associated with SSc-related digestive involvement, as well as their pro-inflammatory and pro-fibrotic functions. This project could uncover new therapeutic targets for treating intestinal forms of SSc.

Prerequisites: Theoretical and practical knowledge in immunofluorescence/immunohistochemistry and immunology. Skills in communication, organization, and teamwork are also required to collaborate effectively with technological platforms and the research team.
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Début de la thèse : 01/10/2025

Contrat doctoral libre

Université de Bordeaux

154 Sciences de la Vie et de la Santé

Personne enthousiaste et autonome. Passionnée par la recherche translationnelle et les sciences médicales et de la vie. Compétences en immunologie requises. Expérience en cytométrie, biologie moléculaire, bio-informatique et/ou histologie recherchées.
A motivated and autonomous individual. Passionate about translational research and medical and life sciences. Immunology skills required. Experience in cytometry, molecular biology, bioinformatics and/or histology desired.