Rôle du canal ionique hERG1 dans les syndromes myélodysplasiques // Role of the hERG1 ion channel in myelodysplastic syndromes

Le rôle des canaux ioniques dans les hémopathies malignes est peu exploré contrairement aux cancers solides, où leur expression est associée à des caractéristiques majeurs de la tumeur (prolifération, angiogénèse, migration et invasion). Les syndromes myélodysplasiques (SMD) sont des pathologies pré-leucémiques, caractérisées par une hématopoïèse inefficace et un défaut de production des cellules matures. Au niveau transcriptomique, le canal hERG1 est surexprimé dans les SMD de faible risque, notamment dans les SMD caractérisés par une mutation du gène SF3B1 et cette surexpression semble associée à une meilleure survie globale. Le gène KCNH2, codant pour ce canal ionique, est exprimé de façon homogène dans les cellules hématopoïétiques avec néanmoins une légère surexpression dans la lignée érythropoïétique. L'objectif principal de ce travail est l'étude précise de l'expression de hERG1 au cours de l'érythropoïèse normale et pathologique dans les SMD mutés SF3B1 mais également au décours de la myélopoïèse (granulopoïèse et monocytopoïèse) par cytométrie en flux, grâce à des panels connus et bien caractérisés. Dans un deuxième temps, l'étude des conséquences fonctionnelles de l'expression de hERG1 sera envisagée, par des expériences de flux calcique et de patch clamp. En parallèle, des données de RNA sequencing sont disponibles chez des patients avec SMD de faible et haut risque. Leur exploitation permettra une meilleure compréhension du rôle de ce canal dans les SMD, ouvrant la voie à de nouvelles expériences.
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The role of ion channels in haematological malignancies is little explored, unlike in solid cancers, where their expression is associated with major tumour characteristics (proliferation, angiogenesis, migration and invasion). Myelodysplastic syndromes (MDS) are pre-leukaemic diseases characterised by inefficient haematopoiesis and a defect in the production of mature cells. At transcriptomic level, the hERG1 channel is over-expressed in low-risk MDS, particularly in MDS characterised by a mutation in the SF3B1 gene, and this over-expression appears to be associated with better overall survival. The KCNH2 gene, encoding this ion channel, is homogeneously expressed in haematopoietic cells, with a slight overexpression in the erythropoietic lineage. The main objective of this work is to study the precise expression of hERG1 during normal and pathological erythropoiesis in SF3B1-mutated MDS, as well as during myelopoiesis (granulopoiesis and monocytopoiesis) by flow cytometry, using known and well-characterised panels. Secondly, the functional consequences of hERG1 expression will be studied using calcium flow and patch clamp experiments. In parallel, RNA sequencing data are available from patients with low- and high-risk MDS. Using these data will provide a better understanding of the role of this channel in MDS, paving the way for new experiments.
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Début de la thèse : 01/10/2025

Public funding alone (i.e. government, region, European, international organization research grant)

Concours pour un contrat doctoral

Université de Picardie - Jules Verne

585 Sciences, Technologie, Santé

Doctorant ayant des compétences en cytométrie en flux, culture cellulaire (cellules primaires CD34+, shRNA), techniques scientifiques usuelles (Western Blot, qPCR). Autonomie, curiosité, motivation et travail en équipe indispensables.
PhD student with skills in flow cytometry, cell culture (primary CD34+ cells, shRNA), standard scientific techniques (Western Blot, qPCR). Autonomy, curiosity, motivation and teamwork essential.