Etude de la formation de biofilm mono-espèce et mixte par Listeria monocytogenes dans les conditions industrielles de trois filières agroalimentaires

L' Agence nationale de sécurité de l'environnement, de l'alimentation et du travail (ANSES) apporte les repères scientifiques nécessaires pour protéger notre santé contre les risques associés à l'alimentation, l'environnement et le travail, ou qui affecrznt les animaux et les plantes. Elle étudie, évalue et surveille les risques chimiques, microbiologiques et pgysique et aide ainsi les pouvoirs publics à prendre les mesures nécessaires, y compris en cas de crise sanitaire. Agence nationale au service de l'interêt général, l'Anses relève des ministères chargés de la santé, de l'environnement, de l'agriculture, du travail et de la consommation. Face aux menaces nouvelles liées aux évolution du climat., des technologies et nos choix de société, elle oeuvre chauqe jour à mobiliser la science pour un monde plus sûr, plus sain, pour tous

Nous recherchons un étudiant de fin master ou équivalent pour la réalisation du stage.

Vos missions:
Sous l’autorité hiérarchique du chef d’unité qui porte également la fonction de responsable d’équipe, le stagiaire recruté sera impliqué dans un programme de recherche visant à étudier l’impact de la flore annexe dans des conditions industrielles sur le développement et la survie de L. monocytogenes en biofilm dans un contexte multifilière. La personne travaillera en collaboration avec un doctorant sur cette action. Le stagiaire sera amené à réaliser les travaux scientifiques portant sur la thématique de la formation des biofilms dans des conditions industrielles stressantes par des techniques de microbiologie et de biologie moléculaire.

Votre équipe :
Le laboratoire de sécurité des aliments (LSAl) est situé sur deux sites, Maisons-Alfort et Boulogne-sur-Mer. Le site de Boulogne-sur-Mer, spécifique des produits de la pêche et de l’aquaculture, intervient sur les dangers biologiques et chimiques apportés par les aliments et qui peuvent affecter la santé des consommateurs. Il exerce des missions de référence, de recherche, de surveillance et d’expertise sur les contaminants biologiques (Listeria monocytogenes, Vibrio spp., Anisakidae) et chimiques (histamine, microplastiques). Vous serez au sein de l’unité sécurité sanitaire des aliments d’origine aquatique (SANAQUA), dans l’équipe de bactériologie composée de 9 agents. Elle a des activités de recherche et d’expertise dans le domaine des contaminants biologiques des produits de la pêche et de l’aquaculture (bactéries et parasites) présentant un danger pour le consommateur et ayant un impact en santé publique. Dans ce contexte, la thèse INTERACLIM est actuellement en cours est vise à déterminer Le rôle des interactions écologiques sur le développement et la survie de L. monocytogenes avec une approche multifilière.

Votre quotidien:

Les activités de ce stage seront réalisées dans le cadre de la thèse INTERACLIM.
Activité 1 : Etude du rôle des interactions bactériennes sur la formation des biofilms de L. monocytogenes dans des conditions industrielles
-    Culture des biofilms mono-espèces et mixtes de L. monocytogenes sur des surfaces, des températures retrouvées dans les industries agroalimentaires de la filière pêche, de la charcuterie et de produits végétaux.
-    Extraction ADN des biofilms
-    Détection et quantification des bactéries (L. monocytogenes et flore annexe) par les techniques classiques de microbiologie classique et de biologie moléculaire (qPCR, PMAqPCR).
Activité 2 : Etude de l’impact des biocides sur la formation des biofilms mono-espèces et mixtes de L. monocytogenes dans des conditions industrielles
-    Culture des biofilms mono-espèces et mixtes de L. monocytogenes sur les surfaces avec des concentrations de biocides identifiés dans les industries agroalimentaires des trois filières.
-    Détection et quantification des bactéries (L. monocytogenes et flore annexe) par les techniques classiques de microbiologie classique et de biologie moléculaire
Activité 3 : Traitement de données
-    Veille scientifique
-    Analyses des données
-    Rédaction du rapport et présentation orale
 

Formation et expérience requises :

Bac +4 en biologie moléculaire, microbiologie

Une maitrise des techniques de biologie moléculaire (qPCR, extraction ADN) est indispensable

Compétences :

Savoir appliquer des protocoles et tenir un cahier de laboratoire

Avoir des connaissances générales en microbiologie, biologie moléculaire

Posséder des compétences élémentaires nécessaires au travail scientifique : rigueur, efficacité, autonomie

Maîtriser l’anglais scientifique

Appliquer les règles d’hygiène et de sécurité

Travailler en mettant en œuvre et en respectant la démarche qualité en recherche