Etude du mécanisme d’action de la mycosubtiline sur le champignon phytopathogène Botrytis cinerea

Ce stage se déroulera au sein de l’UMR GEC CNRS 7025 à l’Université de Technologie de Compiègne et dans le cadre d’une collaboration avec la société Eléphant Vert, financeur du stage, qui a pour ambition de développer une agriculture durable et performante au niveau mondial.

Contexte et objectif :

Le remplacement des pesticides de synthèse par des alternatives durables respectueuses de l’environnement et de la santé humaine est un enjeu majeur pour l’agriculture. La mycosubtiline est un lipopeptide naturellement produit par des bactéries du genre Bacillus ayant des propriétés antifongiques très intéressantes. Faiblement écotoxique et biodégradable, elle est une alternative prometteuse aux fongicides conventionnels. Ce stage a pour objectif principal de renforcer les connaissances sur le mécanisme d’action de la mycosubtiline sur le champignon phytopathogène Botrytis cinerea responsable de la pourriture grise sur de nombreuses espèces végétales.

Méthodologie :

Après une synthèse bibliographique complète des données disponibles dans la littérature, il s’agira de réaliser des expériences essentiellement par une étude de microscopie (confocale, électronique) pour étudier l’effet des molécules sur le champignon. Des mutants de B. cinerea de la voie de biosynthèse de lipides membranaires ont été obtenus par une stratégie CrispR/Cas9 au laboratoire GEC. La sensibilité de ces mutants à la mycosubtiline sera étudiée (perméabilisation, inhibition de croissance). Des souches plus ou moins sensibles à la mycosubtiline permettront également de quantifier la teneur en lipides membranaires

Etudiant de Master 2 et/ou Ingénieur motivé par l'agroécologie, la protection des cultures, le biocontrôle.

Connaissances requises sur les microorganismes pathogènes et les mécanismes de défense des plantes.

Rigueur, ponctualité, implication exigés.