Investiguer la stabilisation et les rôles biologiques des quadruplexes G de l'ARN 5' UTR de KRAS en utilisant l'agrafage chimique // Investigating the Stabilization and Biological Roles of KRAS 5' UTR RNA G-Quadruplexes Using chemical Stapling
ABG-128590
ADUM-60798 |
Thesis topic | |
2025-02-14 |
Université de Bordeaux
Bordeaux cedex - France
Investiguer la stabilisation et les rôles biologiques des quadruplexes G de l'ARN 5' UTR de KRAS en utilisant l'agrafage chimique // Investigating the Stabilization and Biological Roles of KRAS 5' UTR RNA G-Quadruplexes Using chemical Stapling
- Biology
G-quadruplexes , chimie interface biochimie , acides nucléiques, cancer , RMN, KRAS
G-quadruplexes , interface chemistry-biochemistry , nucleic acids , cancer , KRAS, NMR
G-quadruplexes , interface chemistry-biochemistry , nucleic acids , cancer , KRAS, NMR
Topic description
Les quadruplexes G (G4) sont des structures non canoniques d'acides nucléiques formées par des séquences riches en guanine, capables de jouer des rôles régulateurs dans l'expression des gènes, en particulier dans les oncogènes tels que KRAS. La région non traduite (UTR) 5' de l'ARNm KRAS contient des séquences formant des G4 qui sont essentielles pour la régulation post-transcriptionnelle de l'expression des gènes. Les quadruplexes G dans les régions UTR des ARNs régulent l'expression des gènes en influençant des processus comme la traduction. Dans le cas de KRAS, un oncogène clé, ces structures peuvent moduler l'expression, ce qui est crucial dans les cancers dépendants de KRAS. Étudier et stabiliser ces G4 permettrait de mieux comprendre leurs rôles biologiques et d'ouvrir des perspectives thérapeutiques.
Des études précédentes ont démontré que les méthodes d'agrafage photochimique peuvent améliorer la stabilité des structures G4 tout en préservant leur activité biologique. Ce projet vise à appliquer ces techniques aux G4 de l'UTR 5' de l'ARNm de KRAS, permettant une analyse structurelle et fonctionnelle détaillée et explorant leurs implications thérapeutiques.
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G-quadruplexes (G4s) are non-canonical nucleic acid structures formed by guanine-rich sequences, capable of playing regulatory roles in gene expression, particularly within oncogenes such as KRAS. G-quadruplexes in UTR regions of RNAs regulate gene expression by impacting processes like translation. For KRAS, a critical oncogene, these structures can modulate expression, which is pivotal in KRAS-driven cancers. Studying and stabilizing these G4s would enhance understanding of their biological roles and unlock therapeutic potential. These G4 structures display conformational polymorphism influenced by environmental factors, complicating their study and potential therapeutic exploitation. Previous studies have demonstrated that photochemical 'stapling' methods can enhance the stability of G4 structures while preserving biological activity. This project aims to apply these techniques to the mRNA KRAS 5' UTR G4, enabling detailed structural and functional analysis, and exploring the therapeutic implications.
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Début de la thèse : 01/10/2025
WEB : https://arna.cnrs.fr/
Des études précédentes ont démontré que les méthodes d'agrafage photochimique peuvent améliorer la stabilité des structures G4 tout en préservant leur activité biologique. Ce projet vise à appliquer ces techniques aux G4 de l'UTR 5' de l'ARNm de KRAS, permettant une analyse structurelle et fonctionnelle détaillée et explorant leurs implications thérapeutiques.
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G-quadruplexes (G4s) are non-canonical nucleic acid structures formed by guanine-rich sequences, capable of playing regulatory roles in gene expression, particularly within oncogenes such as KRAS. G-quadruplexes in UTR regions of RNAs regulate gene expression by impacting processes like translation. For KRAS, a critical oncogene, these structures can modulate expression, which is pivotal in KRAS-driven cancers. Studying and stabilizing these G4s would enhance understanding of their biological roles and unlock therapeutic potential. These G4 structures display conformational polymorphism influenced by environmental factors, complicating their study and potential therapeutic exploitation. Previous studies have demonstrated that photochemical 'stapling' methods can enhance the stability of G4 structures while preserving biological activity. This project aims to apply these techniques to the mRNA KRAS 5' UTR G4, enabling detailed structural and functional analysis, and exploring the therapeutic implications.
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Début de la thèse : 01/10/2025
WEB : https://arna.cnrs.fr/
Funding category
Funding further details
Appel à projets - UB PhD Scholarships
Presentation of host institution and host laboratory
Université de Bordeaux
Institution awarding doctoral degree
Université de Bordeaux
Graduate school
154 Sciences de la Vie et de la Santé
Candidate's profile
étudiant intéressée par l'interface chimie-biologie
Students interested in subjects at the interface between biology and chemistry
Sont éligibles uniquement des candidatures internationales, à savoir :
- des candidates ou candidats ayant obtenu (ou en cours d'obtention de) leur diplôme d'accès au doctorat (Master ou équivalent) dans un établissement à l'étranger
- des candidates ou candidats actuellement dans un Graduate Program de l'université de Bordeaux, inscrits en deuxième année de Master et ayant obtenu leur diplôme d'accès au Master dans un établissement à l'étranger
Seront prises en compte uniquement les candidatures soumises sur la plateforme suivante : https://aap.u-bordeaux.fr/ et avant le 17 mars à 23h59 (GMT Paris).
Un guide de candidature ainsi que la liste des documents à soumettre sont disponibles sur la plateforme.
Pour toute question, veuillez contacter : internationalisation.doctorat@u-bordeaux.fr
1. Strong academic background in molecular biology, chemistry , biochemistry, or a related field. 2. Experience with nucleic acid chemistry, structural biology techniques (e.g., NMR, CD spectroscopy), or computational modeling is highly desirable. 3. Familiarity with cell-based assays and molecular biology methods (e.g., transcription-translation assays, EMSA). 4. Motivation to work on interdisciplinary projects, combining experimental and computational approaches. 5. Proficiency in scientific communication, with the ability to present results clearly and write reports or publications The UB PhD scholarship program is open to international candidates only, which means: - candidates holding (or currently enrolled in) a national level master's degree or another degree conferring master's status from a foreign institution - candidates currently in a Graduate Program, enrolled in second year of Master at the University of Bordeaux, and holding a degree from a foreign institution We will only consider applications submitted on the following platform: https://aap.u-bordeaux.fr/ and prior March 17, at 11:59pm (GMT Paris). A guide on how to apply as well as the list of documents to submit are available on the platform. For any question, please contact: internationalisation.doctorat@u-bordeaux.fr
1. Strong academic background in molecular biology, chemistry , biochemistry, or a related field. 2. Experience with nucleic acid chemistry, structural biology techniques (e.g., NMR, CD spectroscopy), or computational modeling is highly desirable. 3. Familiarity with cell-based assays and molecular biology methods (e.g., transcription-translation assays, EMSA). 4. Motivation to work on interdisciplinary projects, combining experimental and computational approaches. 5. Proficiency in scientific communication, with the ability to present results clearly and write reports or publications The UB PhD scholarship program is open to international candidates only, which means: - candidates holding (or currently enrolled in) a national level master's degree or another degree conferring master's status from a foreign institution - candidates currently in a Graduate Program, enrolled in second year of Master at the University of Bordeaux, and holding a degree from a foreign institution We will only consider applications submitted on the following platform: https://aap.u-bordeaux.fr/ and prior March 17, at 11:59pm (GMT Paris). A guide on how to apply as well as the list of documents to submit are available on the platform. For any question, please contact: internationalisation.doctorat@u-bordeaux.fr
2025-03-17
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