Ingénieur en Modélisation Écologique H/F

Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète

Des abysses à la surface, de la côte au large, l’Ifremer est l’institut de recherche français entièrement dédié à l’Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines. 

L’Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l’océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d’armement Genavir, l’Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l’océan.

Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer. 

Date de clôture de réception de candidatures : 07/05/2025

Qui sommes-nous ?

Le laboratoire d'écologie pélagique de l'unité DYNECO (https://dyneco.ifremer.fr/Qui-sommes-nous/) étudie les écosystèmes pélagiques côtiers anthropisés. Le laboratoire réunit une trentaine de chercheur(e)s, ingénieur(e)s, technicien(ne)s et doctorant(e)s autour de projets nationaux et internationaux (https://dyneco.ifremer.fr/Qui-sommes-nous/Ecologie-pelagique-PELAGOS/PELAGOS/PROJETS), qui mobilisent des compétences en biogéochimie, biologie moléculaire, écologie et modélisation numérique.

Quelle sera votre mission ?

Nous recrutons dans notre équipe un(e) ingénieur(e) en charge du développement et du déploiement de modèles numériques déterministes des écosystèmes côtiers. Nous vous proposons ainsi de contribuer à enrichir et promouvoir le code communautaire CROCO (Coastal and Regional Ocean COmmunity model, https://www.croco-ocean.org/), plus particulièrement dans sa dimension écologique et biogéochimique. Ce code vient d'être labellisé par l'INSU et rattaché à l'Infrastructure de recherche Littorale et Côtière (IR ILICO : https://www.ir-ilico.fr/?PagePrincipale).

Vous aurez en charge le suivi et le développement de codes biogéochimiques dédiés à l'étude intégrée des pressions anthropiques sur l'écosystème côtier. Le code BLOOM sera dans un premier temps prioritaire car il est déjà en phase de couplage avec les modèles CROCO et MUSTANG (https://croco-ocean.gitlabpages.inria.fr/croco\_doc/model/model.modules.sediment\_mustang.html). Vous serez en charge de maintenir ces codes opérationnels et portables. Vous contribuerez à la mise en ligne d'une documentation détaillée et didactique, et à la formation des nouveaux utilisateurs.

Vous aurez également pour mission de contribuer à l'animation de la communauté nationale et internationale impliquée dans la modélisation biogéochimique couplée physique-biologie en milieu côtier.

Quelles seront vos activités ?

Vous aurez comme missions principales :
- D'assurer le maintien à l'état de l'art des codes de modélisation couplée physique/biologie développés au sein du laboratoire (module BLOOM) avec la mise en ligne d'une documentation détaillée et didactique,
- De continuer à améliorer le couplage de codes biogéochimiques avec le code communautaire CROCO, pour enrichir leur diversité et proposer des innovations,
- De contribuer à mettre en oeuvre des simulations régionales de scénarios climatiques au sein de projets structurants à l'Ifremer (e.g. PPR RIOMAR : https://riomar.lsce.ipsl.fr/, PPR MEDIATION : https://oceansconnectes.org/mediation),
- De collaborer avec les techniciens, ingénieur(e)s, et chercheur(e)s de cette unité et plus largement de l'Ifremer (LOPS, HALGO, PHYTNESS, COAST) et de ses partenaires scientifiques (CNRS, Univ.).

Vous contribuerez donc à l'animation de la communauté nationale et internationale impliquée dans la modélisation biogéochimique couplée physique-biologie en milieu côtier.

Comment se déroulera votre activité ?

- Poste à temps plein
- Périmètre géographique : international

Qui êtes vous ?

- Ingénieur (ou docteur) en développement informatique et modélisation numérique couplée
- Expérience approfondie en programmation, et calcul haute performance. Une expérience de modélisation utilisant le code communautaire CROCO sera appréciée.

Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes :
- Optimisation, débogage des algorithmes et calcul haute performance (parallélisation : MPI, OpenMP, GPU...)
- Maîtrise de plusieurs langages de programmation parmi lesquels Python, R, Fortran
- Expertise avancée dans les outils de gestion de versions des codes informatiques tels que Git et le logiciel de forge GitLab.
- Maîtrise des outils de modélisation couplée hydrodynamique/biologie, connaissance de modèles biogéochimiques et écologiques
- Connaissances élémentaires a minima des dynamiques biogéochimiques (colonne d'eau, sédiment) et physique (marées, courants, vagues), et de leurs interactions en milieu côtier.
- Compréhension des analyses et paramétrages des modèles (calibration, validation, étude de stabilité et de sensibilité).
- Capacité à intégrer différentes échelles d'analyse et approches disciplinaires.

Vous avez les qualités suivantes :
- Excellentes aptitudes relationnelles avec des spécialistes de différentes disciplines
- Capacité à développer des projets de recherche et à obtenir des financements compétitifs.
- Excellentes compétences rédactionnelles et de communication en français et en anglais.
- Capacité à travailler en équipe et à collaborer avec des partenaires académiques, institutionnels et industriels.

Quels sont nos avantages ?
- Nous avons un accord de télétravail (demande possible après 6 mois d'ancienneté) et nos collaborateurs bénéficient de 12 RTT et congés supra légaux.
- Nous consacrons un budget conséquent au développement des compétences, par des actions individuelles ou collectives.
- Nous sommes engagés dans une politique RSE inspirée des raisons d'être de l'institut (forfait mobilité durable...)

Quelles sont les prochaines étapes ?
- Échange en visioconférence ou par téléphone pour une préqualification.
- Entretien, lors d'une commission de recrutement, avec des interlocuteurs techniques et RH.
- Entretien avec le directeur du département.
- Validation du dossier par la direction.