Sirtuines and lysine acétyltransférases: nouvelles cibles pour de nouvelles molécules antibiofilm

Contexte du projet
Face à la résistance de plus en plus alarmante des bactéries aux antibiotiques, il est urgent de mieux comprendre les mécanismes de survie des bactéries et de trouver de nouvelles cibles thérapeutiques pour le développement de nouvelles molécules antibactériennes. Dans ce contexte, les modifications post-traductionnelles (PTM) constituent une piste d'étude intéressante. Elles sont cruciales pour réguler les fonctions cellulaires dans tous les organismes vivants, sur des échelles de temps courtes. Parmi les PTM, l’acétylation est une PTM pour laquelle peu de choses sont connues (acteurs impliqués et rôle). Or, nous avons obtenu des données préliminaires intéressantes montrant que l'acétylation joue un rôle crucial chez la bactérie Acinetobacter baumannii, de nouveau classée Priorité Critique par l’OMS en 2024 et pour laquelle il est urgent de trouver de nouvelles stratégies de lutte. Par conséquent, cibler les acteurs impliqués dans l'acétylation peut être une stratégie antibactérienne prometteuse, comme cela a été démontré pour traiter certains cancers et des infections virales latentes.

Objectifs du projet
L'objectif du projet SUCOMB (financement ANR) est de mieux comprendre le processus d'acétylation notamment l’implication cette PTM dans la fonction de certaines protéines spécifiques impliquées dans la formation de biofilm. L’objectif est aussi de proposer de nouvelles molécules pour lutter contre la formation de biofilms et la persistance environnementale d'A. baumannii en ciblant les protéines impliquées dans l'ajout ou l'élimination de l'acétylation.

L’équipe BRICS (Biofilms, Résistance, Interactions Cellules-Surfaces - laboratoire PBS - UMR 6270 CNRS) a développé des stratégies et acquis une solide expérience en biofilms bactériens et en analyse protéomique pour identifier les protéines modifiées, comme le démontrent les articles publiés.
Elle est internationalement reconnue pour ses travaux sur Acinetobacter baumannii  et sur les modifications post-traductionnelles. Elle intervient dans différents programmes nationaux, européens et internationaux.
De plus, l'équipe BRICS possède l’infrastructure adéquate pour la réalisation de ces travaux en microbiologie. Les analyses protéomiques se feront sur la plateforme protéomique PISSARO, labellisée IBISA.

La/le doctorant(e) recruté sur le projet ANR SUCOMB intègrera l’équipe BRICS du laboratoire PBS (Université de Rouen).La/le candidat(e) devra posséder des compétences en microbiologie (tests phénotypiques, cultures…). Des compétences en biologie moléculaire (PCR, mutagénèse dirigée, analyse de séquences, construction de vecteurs d’expression protéique…) et/ou en analyse protéomique seront appréciées.
La/le candidat(e) participera à la rédaction des rapports de suivi du projet, des protocoles, des publications ainsi qu’à l’encadrement de stagiaires. La personne recrutée participera aux taches collectives s’inscrivant dans la vie du laboratoire.

Seuls les dossiers des candidats ayant un Master avec des enseignements en chimie analytique ou en microbiologie seront considérés. La motivation, la curiosité ainsi que l’envie d’apprendre de nouvelles techniques et domaines d’étude seront appréciées pour la sélection du candidat.